MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 25737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012811	GTC	2	6	52659	52664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141812
1002	NC_012811	CGAC	2	8	52700	52707	25 %	0 %	25 %	50 %	240141813
1003	NC_012811	GC	3	6	52780	52785	0 %	0 %	50 %	50 %	240141813
1004	NC_012811	CGC	2	6	52913	52918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141813
1005	NC_012811	GGCG	2	8	52925	52932	0 %	0 %	75 %	25 %	240141813
1006	NC_012811	TTG	2	6	52987	52992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141813
1007	NC_012811	TCT	2	6	53006	53011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141813
1008	NC_012811	CGA	2	6	53057	53062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1009	NC_012811	CGT	2	6	53066	53071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1010	NC_012811	CCT	2	6	53093	53098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141813
1011	NC_012811	CGA	2	6	53105	53110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1012	NC_012811	GAC	2	6	53128	53133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1013	NC_012811	GCG	2	6	53177	53182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141813
1014	NC_012811	CGC	2	6	53207	53212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141813
1015	NC_012811	CGG	2	6	53234	53239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141813
1016	NC_012811	TCG	2	6	53254	53259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1017	NC_012811	CTT	2	6	53271	53276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141813
1018	NC_012811	GC	3	6	53316	53321	0 %	0 %	50 %	50 %	240141813
1019	NC_012811	CGG	2	6	53325	53330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141813
1020	NC_012811	ACG	2	6	53371	53376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1021	NC_012811	TGC	2	6	53383	53388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1022	NC_012811	CCG	2	6	53434	53439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141813
1023	NC_012811	GCA	2	6	53450	53455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1024	NC_012811	GAC	2	6	53463	53468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1025	NC_012811	CGA	2	6	53567	53572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1026	NC_012811	CCG	2	6	53722	53727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141813
1027	NC_012811	GTC	2	6	53836	53841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1028	NC_012811	GAT	2	6	53844	53849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141813
1029	NC_012811	CAGC	2	8	53859	53866	25 %	0 %	25 %	50 %	240141813
1030	NC_012811	CGT	2	6	53867	53872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141813
1031	NC_012811	CGC	2	6	53873	53878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141813
1032	NC_012811	TGT	2	6	53897	53902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141813
1033	NC_012811	GC	3	6	53946	53951	0 %	0 %	50 %	50 %	240141814
1034	NC_012811	CGT	2	6	53952	53957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141814
1035	NC_012811	GGC	2	6	53984	53989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141814
1036	NC_012811	GCC	2	6	54005	54010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141814
1037	NC_012811	GGA	2	6	54017	54022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141814
1038	NC_012811	CGT	2	6	54042	54047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141814
1039	NC_012811	AGG	2	6	54074	54079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141814
1040	NC_012811	GGCG	2	8	54118	54125	0 %	0 %	75 %	25 %	240141814
1041	NC_012811	CGG	2	6	54134	54139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141814
1042	NC_012811	GC	3	6	54237	54242	0 %	0 %	50 %	50 %	240141814
1043	NC_012811	CCT	2	6	54252	54257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141814
1044	NC_012811	CAG	2	6	54301	54306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141814
1045	NC_012811	CGG	2	6	54351	54356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141814
1046	NC_012811	CCT	2	6	54384	54389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141814
1047	NC_012811	GCC	2	6	54400	54405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141814
1048	NC_012811	CGG	2	6	54418	54423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141815
1049	NC_012811	TCG	2	6	54472	54477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1050	NC_012811	CGA	2	6	54536	54541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1051	NC_012811	CG	3	6	54564	54569	0 %	0 %	50 %	50 %	240141815
1052	NC_012811	GC	4	8	54596	54603	0 %	0 %	50 %	50 %	240141815
1053	NC_012811	CGT	2	6	54644	54649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1054	NC_012811	TGC	2	6	54671	54676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1055	NC_012811	GTC	3	9	54717	54725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1056	NC_012811	CGG	2	6	54788	54793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141815
1057	NC_012811	TCGA	2	8	54811	54818	25 %	25 %	25 %	25 %	240141815
1058	NC_012811	GCC	2	6	54822	54827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141815
1059	NC_012811	GGT	2	6	54846	54851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141815
1060	NC_012811	GCC	2	6	54855	54860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141815
1061	NC_012811	CGATCG	2	12	54869	54880	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1062	NC_012811	TCG	3	9	54910	54918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1063	NC_012811	GGC	2	6	54936	54941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141815
1064	NC_012811	CTC	2	6	55047	55052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141815
1065	NC_012811	GCT	2	6	55061	55066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1066	NC_012811	GAA	2	6	55071	55076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141815
1067	NC_012811	CGC	2	6	55115	55120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141815
1068	NC_012811	CGG	2	6	55127	55132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141815
1069	NC_012811	TTG	2	6	55231	55236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141815
1070	NC_012811	CTC	2	6	55239	55244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141815
1071	NC_012811	CGGA	2	8	55306	55313	25 %	0 %	50 %	25 %	240141815
1072	NC_012811	GCA	2	6	55319	55324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1073	NC_012811	CGT	2	6	55382	55387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1074	NC_012811	CGCGC	2	10	55419	55428	0 %	0 %	40 %	60 %	240141815
1075	NC_012811	CTT	2	6	55431	55436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141815
1076	NC_012811	TGC	2	6	55440	55445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141815
1077	NC_012811	GCG	2	6	55532	55537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141816
1078	NC_012811	CAT	2	6	55559	55564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141816
1079	NC_012811	GCG	2	6	55567	55572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141816
1080	NC_012811	CGA	2	6	55594	55599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141816
1081	NC_012811	GC	4	8	55612	55619	0 %	0 %	50 %	50 %	240141816
1082	NC_012811	CCA	2	6	55655	55660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141816
1083	NC_012811	AGC	2	6	55725	55730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141816
1084	NC_012811	ACG	2	6	55731	55736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141816
1085	NC_012811	CGA	2	6	55750	55755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141816
1086	NC_012811	AGA	2	6	55756	55761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141816
1087	NC_012811	GGC	2	6	55767	55772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141816
1088	NC_012811	TCG	2	6	55954	55959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1089	NC_012811	GC	3	6	55981	55986	0 %	0 %	50 %	50 %	240141817
1090	NC_012811	CGC	2	6	56030	56035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141817
1091	NC_012811	GCA	2	6	56072	56077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1092	NC_012811	ATG	2	6	56083	56088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141817
1093	NC_012811	TCG	2	6	56110	56115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1094	NC_012811	TCG	2	6	56171	56176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1095	NC_012811	CGCCGA	2	12	56243	56254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	240141817
1096	NC_012811	GCC	2	6	56267	56272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141817
1097	NC_012811	GC	3	6	56276	56281	0 %	0 %	50 %	50 %	240141817
1098	NC_012811	CGT	3	9	56387	56395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1099	NC_012811	GCG	2	6	56413	56418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141817
1100	NC_012811	GTA	2	6	56424	56429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141817
1101	NC_012811	GAG	2	6	56473	56478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141817
1102	NC_012811	CGT	2	6	56484	56489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1103	NC_012811	GATCAG	2	12	56514	56525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240141817
1104	NC_012811	GAT	2	6	56550	56555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141817
1105	NC_012811	AGG	2	6	56705	56710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141817
1106	NC_012811	CCG	2	6	56738	56743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141817
1107	NC_012811	ATG	2	6	56866	56871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141817
1108	NC_012811	TCG	2	6	56923	56928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141817
1109	NC_012811	GGGAC	2	10	56987	56996	20 %	0 %	60 %	20 %	240141817
1110	NC_012811	CGC	2	6	57056	57061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141818
1111	NC_012811	GCG	3	9	57068	57076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141818
1112	NC_012811	CGG	2	6	57077	57082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141818
1113	NC_012811	GCG	2	6	57163	57168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141818
1114	NC_012811	CGC	2	6	57171	57176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141818
1115	NC_012811	GGGTC	2	10	57192	57201	0 %	20 %	60 %	20 %	240141818
1116	NC_012811	GC	3	6	57216	57221	0 %	0 %	50 %	50 %	240141818
1117	NC_012811	GCCGGT	2	12	57244	57255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	240141818
1118	NC_012811	CCA	2	6	57276	57281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141818
1119	NC_012811	CTT	2	6	57295	57300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141818
1120	NC_012811	CTC	2	6	57301	57306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141818
1121	NC_012811	GGC	2	6	57351	57356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141818
1122	NC_012811	CCTGGG	2	12	57378	57389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	240141818
1123	NC_012811	CG	3	6	57450	57455	0 %	0 %	50 %	50 %	240141818
1124	NC_012811	AGC	2	6	57458	57463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141818
1125	NC_012811	GGC	3	9	57470	57478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141818
1126	NC_012811	AGGT	2	8	57503	57510	25 %	25 %	50 %	0 %	240141818
1127	NC_012811	CGA	2	6	57549	57554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141818
1128	NC_012811	CTCGT	2	10	57599	57608	0 %	40 %	20 %	40 %	240141818
1129	NC_012811	AGG	2	6	57634	57639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141818
1130	NC_012811	GAGG	2	8	57721	57728	25 %	0 %	75 %	0 %	240141818
1131	NC_012811	GGCC	2	8	57756	57763	0 %	0 %	50 %	50 %	240141818
1132	NC_012811	GC	3	6	57803	57808	0 %	0 %	50 %	50 %	240141818
1133	NC_012811	TCC	2	6	57815	57820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141818
1134	NC_012811	TCG	2	6	57827	57832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141818
1135	NC_012811	TCA	2	6	57858	57863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141818
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1139	NC_012811	GAG	2	6	57979	57984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141818
1140	NC_012811	ACGGAG	2	12	57995	58006	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240141818
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1142	NC_012811	CGG	2	6	58033	58038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141818
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1145	NC_012811	CGG	2	6	58132	58137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141819
1146	NC_012811	CCTGCA	2	12	58169	58180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240141819
1147	NC_012811	TCC	2	6	58189	58194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141819
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1149	NC_012811	CGG	2	6	58236	58241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141819
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1151	NC_012811	CGA	2	6	58262	58267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141819
1152	NC_012811	GC	4	8	58302	58309	0 %	0 %	50 %	50 %	240141819
1153	NC_012811	CCT	2	6	58310	58315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141819
1154	NC_012811	CGGC	2	8	58344	58351	0 %	0 %	50 %	50 %	240141819
1155	NC_012811	GCA	2	6	58364	58369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141819
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1159	NC_012811	CGGC	2	8	58450	58457	0 %	0 %	50 %	50 %	240141819
1160	NC_012811	TCT	2	6	58469	58474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141819
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1166	NC_012811	CGG	2	6	59871	59876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141820
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1182	NC_012811	CGA	2	6	60567	60572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141820
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1231	NC_012811	GGCC	2	8	62826	62833	0 %	0 %	50 %	50 %	240141822
1232	NC_012811	CGT	2	6	62835	62840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141822
1233	NC_012811	GCG	2	6	62841	62846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141822
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1242	NC_012811	GGC	2	6	63200	63205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141823
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1245	NC_012811	GAC	2	6	63365	63370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141823
1246	NC_012811	GTC	3	9	63404	63412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141823
1247	NC_012811	GCC	2	6	63418	63423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141823
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1249	NC_012811	GCC	2	6	63552	63557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141823
1250	NC_012811	AGCG	2	8	63573	63580	25 %	0 %	50 %	25 %	240141823
1251	NC_012811	CGA	2	6	63586	63591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141823
1252	NC_012811	CCGG	2	8	63599	63606	0 %	0 %	50 %	50 %	240141823
1253	NC_012811	GTG	2	6	63609	63614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141823
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1359	NC_012811	GACAG	2	10	68202	68211	40 %	0 %	40 %	20 %	240141828
1360	NC_012811	CGT	2	6	68215	68220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141828
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1362	NC_012811	CTCGAT	2	12	68264	68275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240141828
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1365	NC_012811	GGA	2	6	68563	68568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141828
1366	NC_012811	TCC	2	6	68591	68596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141828
1367	NC_012811	GCCG	2	8	68624	68631	0 %	0 %	50 %	50 %	240141828
1368	NC_012811	AGC	2	6	68678	68683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141828
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1370	NC_012811	CTG	3	9	68815	68823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141828
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1373	NC_012811	ACG	2	6	68894	68899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141829
1374	NC_012811	AGCC	2	8	68904	68911	25 %	0 %	25 %	50 %	240141829
1375	NC_012811	GAAGT	2	10	68912	68921	40 %	20 %	40 %	0 %	240141829
1376	NC_012811	CTGGAC	2	12	68944	68955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240141829
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1382	NC_012811	CTG	2	6	69236	69241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141829
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1393	NC_012811	CGG	2	6	72324	72329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141831
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1498	NC_012811	ACT	2	6	79759	79764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141836
1499	NC_012811	GTG	2	6	79769	79774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141836
1500	NC_012811	GAT	2	6	79790	79795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141836

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